Vysvetlenie: Čo je to „hodnota CT“ v teste na Covid-19 a prečo je to dôležité?

Prahová hodnota cyklu sa objavuje v testoch RT-PCR na koronavírus a určuje, či je osoba pozitívna na Covid-19 alebo nie. Do akej miery to koreluje s vírusovou záťažou a závažnosťou ochorenia?

Test RT-PCR deteguje vírus; Hodnota Ct stanovuje meradlo toho, či sa má osoba považovať za pozitívnu. (Expresná fotografia: Amit Mehra)

Jedným z rôznych vedeckých pojmov, ktoré sa pandémiou Covid-19 stala súčasťou verejného slovníka, je „hodnota Ct“ v testoch RT-PCR na určenie, či je pacient pozitívny na Covid-19.

To bolo predmetom nedávnej žiadosti zaslanej vládou štátu Maháráštra Indickej rade pre lekársky výskum (ICMR). Štát sa snažil objasniť, či je vhodné liečiť osobu ako Covid-negatívnu, ak je hodnota Ct vyššia ako 24 a osoba je asymptomatická. Štátni predstavitelia uviedli, že rôzne dokumenty ICMR uviedli rôzne hodnoty Ct a dokonca aj medzi Niti Aayog a Národným centrom pre kontrolu chorôb existujú odlišné názory.

O niekoľko dní neskôr Generálne riaditeľstvo ICMR odpísalo štátnemu ministrovi zdravotníctva, že ICMR prevzalo vstupy z virologických laboratórií v celej krajine, aby dospelo k jedinému hraničnému bodu hodnoty Ct. Všetci pacienti s hodnotou Ct nižšou ako 35 možno považovať za pozitívnych, zatiaľ čo pacienti s hodnotou Ct nad 35 možno považovať za negatívnych, uviedla ICMR.

Ale aká je hodnota Ct?

Skratka pre prah cyklu, Ct je hodnota, ktorá sa objavuje počas testov RT-PCR, zlatého štandardu na detekciu koronavírusu SARS-CoV-2. V teste RT-PCR sa RNA extrahuje z tampónu odobraného od pacienta. Potom sa premení na DNA, ktorá sa potom amplifikuje. Amplifikácia sa týka procesu vytvárania viacerých kópií genetického materiálu — v tomto prípade DNA. To zlepšuje schopnosť testu odhaliť prítomnosť vírusu. Amplifikácia prebieha prostredníctvom série cyklov – z jednej kópie sa stanú dve, z dvoch štyri atď. – a po niekoľkých cykloch sa vytvorí detekovateľné množstvo vírusu.

Podľa odporúčania ICMR je hodnota Ct reakcie RT-PCR počet cyklov, pri ktorých je možné zistiť fluorescenciu produktu PCR nad signálom pozadia. Zjednodušene povedané, hodnota Ct sa vzťahuje na počet cyklov, po ktorých môže byť vírus detekovaný. Ak je potrebný vyšší počet cyklov, znamená to, že vírus zostal nezistený, keď bol počet cyklov nižší. Čím nižšia je hodnota Ct, tým vyššia je vírusová záťaž – pretože vírus bol zaznamenaný po menšom počte cyklov.

Newsletter| Kliknutím dostanete do doručenej pošty najlepšie vysvetlivky dňa

Prečo je hodnota CT dôležitá?

Aby sme to dali do kontextu, pozrime sa na odporúčanie ICMR a list Maháráštry adresovaný ICMR. Podľa ICMR sa pacient považuje za pozitívneho na Covid, ak je hodnota Ct nižšia ako 35. Inými slovami, ak je vírus detekovateľný po 35 cykloch alebo skôr, potom sa pacient považuje za pozitívneho. Ak by sa referenčná hodnota znížila na 24 – hodnotu uvedenú v liste Maháráštry – znamenalo by to, že hodnoty Ct v rozsahu 25 – 34 by sa nepovažovali za pozitívne. Referenčná hodnota 35 preto znamená, že za pozitívnych by sa považovalo viac pacientov, ako by sme získali, keby bola referenčná hodnota 24. ICMR uviedla, že zníženie prahového parametra Ct môže viesť k zmiznutiu niekoľkých infekčných osôb.

Hodnotu Ct možno považovať za mieru prenosového potenciálu, povedal popredný virológ Dr Shahid Jameel. Takže ak je v mojom hrdle a nose viac vírusu, budem ho lepšie prenášať, povedal Dr Jameel, ktorý je riaditeľom Trivedi School of Biosciences na univerzite Ashoka.

Aký význam má prahová hodnota ICMR 35?

Celosvetovo sa akceptovaná hraničná hodnota pre hodnotu Ct pre Covid-19 pohybuje medzi 35 a 40 v závislosti od pokynov od príslušných výrobcov testovacích zariadení. ICMR dospel k hodnote Ct 35 na základe laboratórnych skúseností a vstupov získaných z niekoľkých virologických laboratórií.

Neexistovalo žiadne nové odporúčanie, ale ICMR informovalo vládu štátu Maháráštra, že nie je vhodné použiť nižší parameter prahu cyklu, pretože by to viedlo k zmiznutiu niekoľkých infekčných osôb a zvýšeniu prenosu chorôb, povedal Dr Balram Bhargava, GR ICMR.

Existuje nejaká korelácia medzi hodnotou Ct a závažnosťou ochorenia?

Nie. Hoci hodnota Ct nepriamo koreluje s vírusovou záťažou, nemá to žiadny vplyv na závažnosť ochorenia, uviedli odborníci. Pacientka môže mať nízku hodnotu Ct, čo znamená, že jej vírusová záťaž je dostatočne vysoká na to, aby bola rýchlo detekovaná, ale stále môže byť asymptomatická.

Malá štúdia publikovaná v Indian Journal of Medical Microbiology v januári tohto roku zistila, že neexistuje žiadna korelácia medzi hodnotami Ct a závažnosťou ochorenia alebo úmrtnosťou u pacientov s ochorením Covid-19. Zistilo sa, že čas od nástupu symptómov má silnejší vzťah s hodnotami Ct v porovnaní so závažnosťou ochorenia.

Hodnota Ct nám hovorí o vírusovej záťaži v krku a nie v pľúcach, povedal Dr Parikshit Prayag, konzultant pre infekčné choroby v nemocnici Deenanath Mangeshkar v Pune. Hodnota Ct nekoreluje so závažnosťou – iba s infekčnosťou. V prvej správe sa skutočne nepozerám na hodnotu Ct, ale pri sledovaní pacientov v nemocnici beriem do úvahy hodnotu Ct, pretože potom sa môžem rozhodnúť, či pacienta premiestnim do budovy mimo Covid alebo nie . Z hľadiska infekčnosti na tom môže záležať, nie na závažnosti, povedal doktor Prayag.

Znamená vysoká hodnota Ct vždy nízku vírusovú záťaž?

Aj keď to môže byť zrejmý záver, niektorí odborníci zdôrazňujú, že niektorí pacienti môžu mať vysokú hodnotu Ct a napriek tomu majú veľmi významnú úroveň infekcie Covid-19 a naopak. Pri interpretácii testu RT-PCR je dôležitých veľa faktorov a výsledky môžu závisieť aj od metódy odberu vzorky a času od infekcie po odber a analýzu.

Poradenstvo ICMR v auguste minulého roka poznamenalo, že hodnoty Ct závisia od spôsobu odberu vzorky. Zle odobratá vzorka môže odrážať nevhodné hodnoty Ct. Okrem toho sú hodnoty Ct určené aj technickou spôsobilosťou osoby, ktorá test vykonáva, kalibráciou zariadenia a analytickými schopnosťami tlmočníkov.

Hodnoty Ct sa opäť môžu líšiť medzi nazálnymi a orofaryngeálnymi vzorkami odobratými od toho istého jedinca. Teplota pri preprave, ako aj čas od odberu po prijatie do laboratória môžu tiež nepriaznivo ovplyvniť hodnoty Ct.

Zdieľajte So Svojimi Priateľmi: