Vysvetlenie: Ako rýchlo sa šíri nový kmeň koronavírusu? Ovplyvní to očkovanie?

Nový kmeň koronavírusu v Spojenom kráľovstve: India a niekoľko ďalších krajín pozastavili lety do a zo Spojeného kráľovstva. Aké mutácie viedli k variantu koronavírusu, ktorý vyvolal obavy? Ako rýchlo sa to rozšírilo? A ovplyvní to očkovanie?

Lety z Británie sú zrušené na letisku Cointrin v Ženeve vo Švajčiarsku 21. decembra 2020. (Foto: Denis Balibouse)

V pondelok India pozastavili všetky lety z a do Spojeného kráľovstva do 31. decembra, uprostred obáv z a nový variant SARS-CoV-2, ktorý sa tam rýchlo šíri a rastie. Niekoľko ďalších krajín tiež pozastavilo lety v Spojenom kráľovstve a zaviedlo cestovné obmedzenia.

Aké sú tieto obavy vedúce k cestovným obmedzeniam?

Minulý týždeň sa ukázalo, že nový variant SARS-CoV-2 je dôvodom rýchleho nárastu prípadov Covid-19 v južnom a východnom Anglicku. Označuje sa ako VUI (Variant Under Investigation) 202012/01 alebo línia B.1.1.7.

Počas niekoľkých posledných dní sme vďaka našej genómovej schopnosti svetovej triedy identifikovali nový variant koronavírusu, ktorý môže súvisieť s rýchlejším šírením v južnom Anglicku, povedal britský minister zdravotníctva Matt Hancock Snemovni reprezentantov. 14. december. Britské úrady už informovali Svetovú zdravotnícku organizáciu o variante.

Organizácia Public Health England (PHE) oznámila, že k 13. decembru bolo identifikovaných 1108 prípadov s týmto variantom, prevažne v južnom a východnom Anglicku. PHE spolupracuje s partnermi na vyšetrovaní a plánuje sa podeliť o svoje zistenia v priebehu nasledujúcich 2 týždňov.

Aký je variant?

Variant bol identifikovaný pri genómovom dohľade COVID-19 Genomics UK (COG-UK), konzorcium, ktoré analyzuje údaje o sekvenovaní genómu zo Spojeného kráľovstva. COG-UK je najväčším prispievateľom do globálnej databázy COVID-19 GISAID.

Variant je výsledkom viacerých mutácií v spike proteíne nového koronavírusu SARS-CoV-2, ako aj mutácií v iných genómových oblastiach vírusu RNA. Predbežná analýza naznačuje, že je prenosnejší ako predtým cirkulujúce varianty. COG-UK identifikovala jednu z týchto mutácií ako N501Y v oblasti spike proteínu, ktorý sa viaže na kľúčový proteín v ľudskej bunke, ACE2 receptor. To naznačovalo, že zmeny môžu teoreticky viesť k tomu, že sa vírus stane infekčnejším. Prebiehajú snahy potvrdiť, či niektorá z týchto mutácií prispieva alebo neprispieva k zvýšenému prenosu, uviedlo konzorcium.

Čo zatiaľ vieme o prenosnosti a závažnosti ochorenia?

V nedeľu PHE uviedol, že údaje zo sekvenovania celého genómu, epidemiológie a modelovania naznačujú, že nový variant sa prenáša ľahšie ako iné kmene.

Zdôraznil však, že neexistuje žiadny dôkaz o tom, že variant s väčšou pravdepodobnosťou spôsobí vážne ochorenie alebo úmrtnosť. ... Ale pokračujeme vo vyšetrovaní, aby sme to lepšie pochopili, povedal. Uviedla, že úmrtnosť je zaostávajúci ukazovateľ a v nasledujúcich týždňoch to bude neustále monitorovať.

PHE povedal, že zatiaľ nepozná mechanizmus tohto zvýšenia prenosu. Vieme, že mutácie v spike proteíne, časti vírusu, ktorá ho robí infekčným, môžu zmeniť spôsob, akým vírus interaguje s ľudskými bunkami.

Uviedla, že dôkazy ukazujú, že miera infekcie v geografických oblastiach, kde tento konkrétny kmeň cirkuluje, sa zvýšila rýchlejšie, ako sa očakávalo, a modelové dôkazy ukázali, že tento variant má vyššiu prenosovú rýchlosť ako iné varianty v súčasnej cirkulácii.

Nový kmeň koronavírusu v Spojenom kráľovstve: Policajt riadi dopravu pri vchode do uzavretého trajektového terminálu v Doveri v Anglicku v pondelok po uzavretí prístavu Dover. (AP Photo)

Nakoľko znepokojuje vyššia prenosnosť?

Dňa 18. decembra Poradná skupina pre nové a vznikajúce respiračné vírusy (NERVTAG), ktorá radí vláde Spojeného kráľovstva v súvislosti s hrozbou, ktorú predstavujú nové a objavujúce sa respiračné vírusy, uviedla, že nový variant by mohol potenciálne zvýšiť reprodukčné číslo choroby až o 0,93. . Uviedla, že má miernu dôveru, že nový variant vykazuje podstatné zvýšenie prenosnosti v porovnaní s inými variantmi.

Odborný orgán však dospel k záveru, že v súčasnosti nie je dostatok údajov na vyvodenie akéhokoľvek záveru o základnom mechanizme zvýšenej prenosnosti, vekovej distribúcii prípadov a závažnosti ochorenia. Uviedla, že boli identifikované 4 úmrtia z približne 1 000 prípadov, ale je potrebná ďalšia práca na porovnanie tejto úmrtnosti s porovnateľnými súbormi údajov.

Umiestnenie mutácií v receptor viažucej doméne vrcholového glykoproteínu zvyšuje možnosť, že tento variant je antigénne odlišný od predchádzajúcich variantov. Medzi 915 subjektmi s týmto variantom boli identifikované štyri pravdepodobné reinfekcie, ale je potrebná ďalšia práca na porovnanie tejto miery reinfekcie s porovnateľnými súbormi údajov.

V nedeľu v krátkom hodnotení hrozieb zverejnenom Európskym centrom pre prevenciu a kontrolu chorôb sa uvádza, že fylogenetická analýza odhaľuje, že klaster sa líši od pôvodného kmeňa Wuhan o 29 nukleotidových substitúcií. Tri sekvencie z Dánska a jedna z Austrálie, zo vzoriek odobratých v novembri 2020, sa zhlukujú s variantom Spojeného kráľovstva, čo s najväčšou pravdepodobnosťou naznačuje, že došlo k medzinárodnému šíreniu, hoci rozsah zostáva neznámy.

Nový kmeň koronavírusu v Spojenom kráľovstve: Prístav Dover sa zatvára, pretože krajiny EÚ uvalili zákaz cestovania zo Spojeného kráľovstva. (Foto Reuters)

Nezmutoval však vírus už predtým?

Kedykoľvek sa vírus replikuje a cirkuluje v ľudskej populácii, mutácie sa vyskytujú prirodzene, rýchlosťou približne jedna až dve mutácie za mesiac v globálnej fylogenéze.

V skutočnosti pre SARS-CoV-2 COG-UK hovorí, že v súčasnosti existuje približne 4 000 mutácií v spike proteíne. Variant D614G bol skôr dominantným kmeňom, pretože sa veľmi ľahko šíril. Ďalší kmeň, ktorý vznikol u španielskych farmárov, 20A. EU1 sa v lete rýchlo rozšírila po Európe.

Je ťažké predpovedať, či je nejaká daná mutácia dôležitá, keď sa prvýkrát objaví, na pozadí neustáleho objavovania sa nových mutácií. Pochopenie ich významu môže byť možné na základe experimentálnej práce, ktorá ukazuje spojenie medzi mutáciou a jemnou zmenou v biológii vírusu. Testovanie účinku mnohých tisícok kombinácií mutácií by si však vyžadovalo značný čas a úsilie, uviedla COG-UK.

Ovplyvní to vývoj vakcín a reakciu?

V nedeľu britské úrady uviedli, že na pochopenie tohto problému sa prioritne vykonávajú ďalšie laboratórne práce. V súčasnosti neexistuje žiadny dôkaz, ktorý by naznačoval, že by vakcína Pfizer nechránila ľudí pred novým kmeňom, povedal PHE.

Zdieľajte So Svojimi Priateľmi: